糖尿病數(shù)據(jù)的可視化分析
2018-07-31 來源:raincent

疾病是人類生活的一部分。我們的歷史上一直不斷和疾病抗爭:從公元前430年在雅典爆發(fā)的天花到最近幾年肆虐美洲大陸的寨卡病毒。幸運的是,科技發(fā)展給現(xiàn)代醫(yī)學帶來的治療方法的變革,已經(jīng)幫助人們?nèi)〉昧丝範幖膊〉母咝У姆椒。而臨床試驗就是這些科學方法的核心。
臨床醫(yī)學對糖尿病的治療帶來很大幫助。我制作了這個R Shiny app原型(你還可以登錄我的 Github頁面查看源代碼,自己做一些更多的探索),它的目標是對美國的糖尿病臨床研究信息,這些信息可以用在以下情況:
• 糖尿病患者對參與新藥物、新治療方法的臨床試驗感興趣,或者想在未來第一時間知道臨床研究的新消息;
• 你對藥物學感興趣,并且想了解更多有關(guān)現(xiàn)實中的臨床試驗的知識;
• 你是醫(yī)療工作者,想要了解臨床實驗的贊助商們,以及可能影響到你所在機構(gòu)的臨床試驗的最新進展;
• 你對投資藥物研究感興趣,想要了解贊助數(shù)據(jù)、產(chǎn)品生產(chǎn)數(shù)據(jù)等;
這個項目的靈感來自 Xiao Jia 之前的一個項目。數(shù)據(jù)集來自 ClinicalTrials.gov,一個存儲美國和世界各國臨床試驗數(shù)據(jù)的網(wǎng)站,資源來自美國國家醫(yī)學圖書館。
為了創(chuàng)建一個App,我的研究僅僅局限在一種特定的疾病(糖尿病),贊助商只包含美國本土的機構(gòu),而且以兩個主要的研究類型(臨床試驗和觀察性研究)為主。簡單來說,臨床試驗通常是在一種藥物或治療方式推向公眾之前,小范圍進行的測試。而觀察性研究則是在藥物已經(jīng)上市后,進行的安全性評估。
App主頁面上有五類信息:簡介,研究信息,年度數(shù)據(jù),贊助數(shù)據(jù)以及地圖。簡介是以視頻形式呈現(xiàn)。研究信息會展示比如贊助類型、糖尿病種類、治療模式、研究進展等特定信息,以柱狀圖呈現(xiàn)。基于這個功能我得出一些發(fā)現(xiàn):
• 糖尿病的臨床試驗數(shù)量多于觀察性研究的數(shù)量;
• 研究通常來自醫(yī)藥公司等行業(yè)內(nèi)公司以及其他機構(gòu)(一些學術(shù)或非盈利組織贊助);
• 最常見的干預類型包括藥物干預,行為干預以及器械干預。


年度數(shù)據(jù)的功能展示了每年開始或完成的研究數(shù)。如果我們看一看不同年份開始的研究數(shù)據(jù),會發(fā)現(xiàn):
• 大多數(shù)研究是由行業(yè)或者其他(研究機構(gòu)、非營利組織)機構(gòu)來資助的
2000年到2010年間,由行業(yè)或其他機構(gòu)資助的臨床試驗陡增。一個可能的原因是糖尿病在這幾年成為一個嚴重的公共安全隱患,引發(fā)更多的研究。
2010年之后,由行業(yè)資助的研究數(shù)下降,由其他機構(gòu)資助的保持不變。這可能意味著行業(yè)內(nèi)不再認為研究糖尿病的治療能夠帶來商業(yè)回報?這個現(xiàn)象值得深入研究。

贊助數(shù)據(jù)以表格形式展示,對不同贊助商的數(shù)據(jù)進行收集整理。表格包括每個贊助商資助的研究數(shù),以及參與者(參與總數(shù)、平均值、最小及最大值)和時長(平均值、近幾年的最小和最大值)的概況。從中你會發(fā)現(xiàn):
• 資助項目最多的10個贊助商中,7個來自行業(yè)內(nèi)
• AstraZeneca資助了最多的研究(168項)
• 國家糖尿病、消化系統(tǒng)及腎臟系統(tǒng)疾病協(xié)會排名前三

在地圖的功能上,我們展示了贊助商在全國的分布情況。你可以選擇查看不同的研究類型并放大地圖查看。最初的地點標示以塊狀展示,當你放大后會分散開,顯示更具體的信息。這可以讓你看到自己所在區(qū)域是否有相應(yīng)的臨床試驗。

這個app僅僅用了兩周左右時間完成。如果有更多時間和精力,它可以在以下方面得到提升:
• 將其他疾病也納入其中
• 將美國以外的贊助商也納入其中
• 將更多研究類型,比如注冊研究等納入其中
另外還可以加入更多的功能,比如顯示疾病發(fā)生所在地信息、受資助的臨床試驗的進展階段。這些額外的功能能夠幫助想要長期投資藥物領(lǐng)域的投資者更好地選擇贊助商。這會提高App的商業(yè)價值。
(本文編譯自技術(shù)博客 Visualizing Diabetes Clinical Studies Data 僅代表作者觀點。)
John Yap是一名在臨床試驗以及觀察性研究方面有多年工作經(jīng)驗的統(tǒng)計學家。
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